Die Bewohner des Planeten Thundera evakuieren kurz bevor er zerstört wird. Sie wurden von einer Bande von Mutanten verfolgt. Alle außer einem ihrer Fluchtschiffe wurden zerstört. Nur eine kleine Gruppe von Thunderans (Thundercats) blieb übrig. Mit nur der halben Motorleistung musste die von Jaga angeführte Gruppe Kurs auf den nächsten Planeten nehmen. Jaga befahl ihr Schiff, während sich die anderen sieben in ihren Stasisrohren befanden. Jaga starb auf ihrer Reise zur Dritten Erde und ihr Schiff stürzte dort ab. Bald freundeten sie sich mit verschiedenen Gruppen in der Gegend an und entwarfen eine Festung. Mumm-Ra, die jahrhundertealte Verkörperung des Bösen, und die Mutanten, die den Rest der Thunderaner zerstört haben, sind eine ständige Bedrohung. Aber Lion-O, der neue Anführer der Thundercats, wird mit seiner Waffe, dem "Schwert des Omens", den Thundercats helfen, eine stehende Chance zu haben.
