Der Animationsfilm von Shinichiro Watanabe (Buch und Regie) erzählt ein zentrales Ereignis der Vorgeschichte: die Androiden-Revolte, bei der das digitale Gedächtnis der Menschheit vernichtet wurde.
Seiya und die Krieger des Zodiac sind erneut dazu berufen, die Reinkarnation der Göttin Athena zu beschützen. Doch eine düstere Prophezeiung schwebt über ihnen.